Giải trình tự gen 1st BASE, dịch vụ giải trình tự gen

DỊCH VỤ GIẢI TRÌNH TỰ DNA

Đối tác đáng tin cậy của bạn để giải trình tự SANGER

GIẢI TRÌNH TỰ SANGER

SẢN PHẨM SỐ SS1001

Single Pass DNA Sequencing
Khách hàng cung cấp sản phẩm PCR tinh sạch hoặc plasmid tinh sạch. Đối với các sản phẩm Plasmid hoặc PCR dài, chúng tôi đảm bảo tối thiểu 850 base từ khuôn mẫu chất lượng tốt trong một phản ứng.

SẢN PHẨM SỐ SS1002

Single Pass DNA Sequencing, 96-well format
Khách hàng cung cấp sản phẩm PCR tinh sạch hoặc plasmid tinh sạch. Để trống giếng H12, 95 mẫu với OD chuẩn hóa.
Đối với các sản phẩm Plasmid hoặc PCR dài, chúng tôi đảm bảo tối thiểu 850 base từ khuôn mẫu chất lượng tốt trong một phản ứng.

SẢN PHẨM SỐ SS120

DNA Sequencing Service + Plus
Khách hàng cung cấp sản phẩm PCR đơn băng chưa tinh sạch.
Đối với sản phẩm PCR dài chưa tinh sạch, chúng tôi đảm bảo tối thiểu 1.000 bazơ từ mẫu chất lượng tốt trong một phản ứng.

1st Base đã cung cấp dịch vụ Giải trình tự Sanger bắt đầu từ hệ thống điện di gel thủ công đến máy phân tích di truyền tự động. 1st Base đã áp dụng hệ thống 96 mao quản, đây là máy phân tích di truyền có công suất cao nhất từ Applied Biosystems® với các quy trình được tối ưu hóa để cung cấp dữ liệu trong thời gian ngắn nhất.

GIẢI PHÁP HOÀN CHỈNH

CHU KỲ GIẢI TRÌNH TỰ
Quy trình đực tối ưu hóa được phát triển cho các mẫu có độ phức tạp khác nhau.

KIỂM SOÁT CHẤT LƯỢNG
Kiểm soát mẫu giải trình tự được thực hiện trong mọi chu kỳ và giải trình tự.

KẾT QUẢ
Kiểm tra chất lượng dữ liệu được thực hiện trước khi gửi kết quả.

CHUẨN BỊ MẪU
Định lượng tất cả các mẫu sau khi nhận. Dịch vụ tinh sạch theo yêu cầu.

1. YÊU CẦU MẪU

SẢN PHẨM: SS1001 - SS1002

- Loại DNA: Purified PCR product [90-250bp] Purified PCR product [251-500bp] Purified PCR product [>500bp] Purified
- Nồng độ & Khối lượng/ Phản ứng:
[90-250b 0 ng/µL, min 20 µL per rxn in dH2O
[251 -500bp] 20 [251-500 ng/µL, min 20 µL per rxn in dH2O
[>500bp] 40 ng/µL, min 20 µL per rxn in dH2O 100 ng/µL, min 20 µL per rxn in dH2O

SẢN PHẨM: SS1201

- Loại DNA: Single band un-purified PCR product
- Nồng độ & Khối lượng/ Phản ứng:
[1 reaction: 100 ng/µL, min 30 µL per rxn in dH2O
2 reactions: 100 ng/µL, min 40 µL per rxn in dH2O

SẢN PHẨM: Primer

- Nồng độ & Khối lượng/ Phản ứng:: 10 µM or 10pmol/ µL, in 10 µL per rxn in dH2O

2. GỬI MẪU

Đối với việc gửi ống, đảm bảo nhãn của mẫu khớp với đơn đặt hàng để tránh quá trình đặt hàng bị chậm trễ.

Nếu ảnh gel được cung cấp, hãy cho biết:
(i) ngõ số mẫu DNA và thang DNA
(ii) tên của mẫu DNA và điểm đánh dấu (ví dụ thang 1kb.100bp)
(iii) tên của mẫu DNA và điểm đánh dấu (ví dụ thang 1kb.100bp)

Nếu không có Thẻ lấy mẫu 1st BASE, vui lòng bọc các đĩa/ống bằng bọc bong bóng trước khi vận chuyển. Đối với lô hàng số lượng lớn, hãy đóng gói tấm trong thùng ĐÓNG CỬA.

3. ĐÓNG GÓI MẪU

Ví dụ của thẻ lấy mẫu (≤ 24 mẫu)

Ví dụ của mẫu hộp đựng (tối đa 100 ống)

4. KIỂM TRA CHẤT LƯỢNG DNA TRƯỚC KHI GỞI ĐI GIẢI TRÌNH TỰ

Phương pháp 1: Điện di trên gel agarose (khuyên dùng)

– DNA tinh sạch sẽ chạy dưới dạng một dải trên gel agarose. Gel agarose tiết lộ DNA và RNA gây ô nhiễm, nhưng không phải là protein và muối.
* Không cắt plasmid – 2 đến 4 dải

Phương pháp 2: Đo quang phổ

– Tỷ lệ A260/A280 phải là 1,8 đến 2,0. Tỷ lệ nhỏ hơn thường chỉ ra sự ô nhiễm bởi protein hoặc hóa chất hữu cơ. Phép đo quang phổ có thể phát hiện sự nhiễm bẩn protein, nhưng không phát hiện nhiễm bẩn DNA, RNA hoặc muối.
Muối ô nhiễm không xuất hiện trong bất kỳ phương pháp định lượng nào – tinh sạch cột!

Chú ý: Thang DNA không áp dụng để so sánh kích thước của các mẫu DNA phi tuyến tính (vd. Plasmid DNA)

5. BẠN NHẬN ĐƯỢC GÌ SAU KHI CÓ KẾT QUẢ GIẢI TRÌNH TỰ GEN?

Hai tệp sẽ được nhận cho mỗi phản ứng

KẾT QUẢ GIẢI TRÌNH TỰ GEN DNA CỦA 1st BASE CÓ TỐT KHÔNG?

Chúng tôi khuyên khách hàng của mình nên sử dụng phần mềm Sequence Scanner, miễn phí từ hệ thống sinh học ứng dụng, để xem dữ liệu trình tự. Trong mỗi phản ứng, chúng tôi nhấn mạnh Giá trị chất lượng (QV), Độ dài đọc liền kề (CRL) & ĐIểm theo dõi.

Xem điện tâm đồ trong Sequence Scanner

1% PE có nghĩa là chính xác 99% hoặc xác suất lỗi là 1 trên100 bases

CRL = Khoảng thời gian dài nhất không bị gián đoạn của các cuộc gọi cơ sở chất lượng cao
Điểm theo dõi = Trung bình QV của một loạt các cơ sở trong trường hợp này Độ dài đọc liền kề hoặc CRL
Bằng cách sử dụng Sequence Scanner, bạn có thể xem kết quả của mình chỉ bằng một cú nhấp chuột để hiển thị báo cáo QC của mọi thứ tự trình tự:

Chế độ theo dõi trong Sequence Scanner - Color represent Quality value - Find/Select > Copy > Paste

Theo dõi trình tự tốt phải có 2 đặc điểm như sau:

1. Giá trị chất lượng tốt (QV) kéo dài liên tục hoặc không bị gián đoạn của cuộc gọi cơ bản.. QV sẽ được hiển thị dưới dạng các thanh hình chữ nhật ở phần trên của điện tâm đồ.
2. Các đỉnh được xác định rõ với hầu như không có hoặc rất ít tín hiệu nền.

TẠI SAO CHỌN 1st BASE ĐỂ GIẢI TRÌNH TỰ

Hàng loạt các primers phổ biến cho mẫu DNA tinh sạch.
Mẫu DNA định lượng 100% trước khi giải trình tự.
Các quy trình tự động nghiêm ngặt bao gồm phản ứng kiểm soát trong mỗi quy trình. Chỉ các phản ứng giải trình tự thông qua QC mới được gửi kết quả cho khách hàng.
Đảm bảo nỗ lực tốt nhất cho mỗi phản ứng mà bạn đã trả tiền.
Không cần phải hỏi, chúng tôi cung cấp và hỗ trợ nhanh chóng.
Dẫn đầu trong việc cung cấp các kết quả đọc dài với chất lượng cao.
Dẫn đầu trong việc giải trình tự các mẫu khác nhau (GC cao, homopolymer, ect).
Thông báo trực tuyến hoặc email về kết quả tải xuống bằng liên kết được lưu trữ trên web được bảo vệ bằng mật khẩu.

Công Ty TNHH Công Nghệ Lab Big Digital

Địa chỉ: Tầng 1, 207A Nguyễn Văn Thủ, P. Đa Kao, Quận 1, TPHCM

Hotline: 0907.118.698

Email: labbigdigital@gmail.com

Website: LABBIG.net - LABBIG.com - thietbiphongthinghiem.net