PRIMETIME™ GENE EXPRESSION MASTER MIX
PrimeTime Gene Expression Master Mix được thiết kế cho các xét nghiệm qPCR dựa trên đầu dò để nghiên cứu biểu hiện gene. Master mix này đảm bảo cung cấp hiệu quả xét nghiệm> 90% trong RT-qPCR hai bước với thử nghiệm PrimeTime 5 ’Nuclease. Nó cũng tương thích với các đầu dò và mồi qPCR khác. Thành phần mỗi bộ bao gồm 2X Master Mix (DNA polymerase hot-start qua trung gian kháng thể, dNTPs, MgCl2, chất tăng cường và chất ổn định) và một dung dịch gốc thuốc nhuộm tham chiếu riêng biệt.
PrimeTime Gene Expression Master Mix hoạt động tốt trong điều kiện chu kỳ nhanh hoặc tiêu chuẩn với singleplex hoặc multiplex (Hình 1) trên nhiều thiết bị PCR thời gian thực, bao gồm 7900HT Fast™ (Thermo Fisher Scientific), QuantStudio™ 7 Flex (Thermo Fisher Scientific), CFX384 Touch™ (Bio-Rad) và LightCycler® 480 (Roche).
Là một phần trong nỗ lực phát triển bền vững của chúng tôi, các nhà khoa học của IDT đã tiến hành thử nghiệm để chứng minh rằng các điều kiện vận chuyển ở nhiệt độ môi trường xung quanh không ảnh hưởng đến chức năng của master mix. Loại bỏ vận chuyển trên đá khô giúp tối đa hóa ngân sách nghiên cứu của bạn, giảm thiểu sự chậm trễ vận chuyển và có lợi cho môi trường. Xem Hình 3 và sách trắng về vận chuyển môi trường xung quanh của chúng tôi.
Hình 1. Khuếch đại PCR nhất quán, hiệu quả cao trong điều kiện chu kỳ nhanh hoặc tiêu chuẩn. qPCR bao gồm qPCR PrimeTime assay, PrimeTime Gene Expression Master Mix, thuốc nhuộm tham chiếu và mẫu được chạy trên hệ thống 7900HT Fast™ (Thermo Fisher Scientific). (A) Biểu đồ này (n = 26) cho thấy hiệu quả PCR được tính toán của 13 xét nghiệm chạy trong điều kiện chu kỳ nhanh bằng cách sử dụng cDNA pha loãng (50–0.016 ng) hoặc các đoạn gen gBlocks™ (101–107 bản sao) làm mẫu. Tất cả các thử nghiệm đều cho thấy hiệu quả PCR 90–110% với R2> 0,99. (B) Ở mỗi nồng độ cDNA (50–0,016 ng; 3 trong số 6 độ pha loãng được hiển thị), sự khác biệt về giá trị Cq được xác định bằng cách sử dụng các điều kiện chu kỳ nhanh hoặc tiêu chuẩn là <1 chu kỳ tiêu chuẩn: 3 phút ở 95°C; 49 x (15 giây ở 95°C; 1 phút ở 60°C). Chu kỳ nhanh: 3 phút ở 95°C; 49 x (5 giây ở 95°C; 30 giây ở 60°C).
Bạn có thể mong đợi kết quả nhất quán, ngay cả khi sử dụng các lô khác nhau của PrimeTime Gene Expression Master Mix (Hình 2). Ngoài ra, master mix này lý tưởng cho các ứng dụng thông lượng cao và các thí nghiệm qua đêm. Nó đã cho thấy sự ổn định nhiệt độ đặc biệt mà không làm giảm hiệu quả khuếch đại hoặc suy giảm chất lượng của các thành phần sau 24 giờ ở nhiệt độ phòng (Hình 2) hoặc ở nhiệt độ cao trong thời gian dài (50°C lên đến 7 ngày) (Hình 3).
Hình 2. Kết quả đáng tin cậy khi sử dụng các lô master mix khác nhau sau ngày 0 và 24 giờ ở nhiệt độ phòng. qPCR bao gồm PrimeTime HPRT qPCR Assay (đầu dò được gắn nhãn FAM; ID xét nghiệm: Hs. PT.58v.45621572), PrimeTime Gene Expression Master Mix, thuốc nhuộm tham chiếu và lượng khác nhau của các đoạn gen gBlocks (3 trong số 7 độ pha loãng được hiển thị: 101– 107 copies, 8 replicate) được chạy ngay lập tức (Ngày 0) hoặc sau 24 giờ (Ngày 1) trên Hệ thống QuantStudio™ 7 Flex (Thermo Fisher Scientific). Độ lệch chuẩn của các giá trị Cq cho các mức mẫu> 10 bản sao là <0,5. Để xem kết quả bổ sung, hãy truy cập www.idtdna.com/qPCRmastermix.
B. Hiệu quả PCR được duy trì sau khi xử lý nhiệt kéo dài
Hình 3. Sau khi xử lý ở 50°C trong tối đa 7 ngày, PrimeTime Gene Expression Master Mix cung cấp hiệu quả PCR cao mà không thay đổi giá trị Cq, khi so sánh với master mix không được xử lý. PrimeTime Master Mix được ủ ở 50°C trong 1, 3, 5, hoặc 7 ngày hoặc ở –20°C cho đến khi sử dụng (đối chứng). Kết quả PCR nhất quán, hiệu quả cao được hiển thị bằng đường cong khuếch đại đại diện (A) và đường cong tiêu chuẩn (B) từ các xét nghiệm HPRT được duy trì ở nhiệt độ phòng trong 24 giờ trước khi chạy trên máy luân nhiệt.